Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL3Q8N8U3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL3Q8N8U3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL3Q8N8U3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms