Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOX2Q8IUF8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOX2Q8IUF8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOX2Q8IUF8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms