Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC27Q6UX04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms