Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms