Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL39P5Q59GN2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P5Q59GN2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms