Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms