Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDRF1Q3B7T1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDRF1Q3B7T1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms