Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN3Q16667 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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