Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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