Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NID2Q14112 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NID2Q14112 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NID2Q14112 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NID2Q14112 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NID2Q14112 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NID2Q14112 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NID2Q14112 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NID2Q14112 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NID2Q14112 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NID2Q14112 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NID2Q14112 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NID2Q14112 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NID2Q14112 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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