Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF3Q13114 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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