Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms