Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 525.6 ms