Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00205P59089 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms