Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP5P51878 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP5P51878 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP5P51878 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP5P51878 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP5P51878 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP5P51878 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP5P51878 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP5P51878 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP5P51878 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP5P51878 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP5P51878 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP5P51878 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP5P51878 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP5P51878 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP5P51878 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP5P51878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP5P51878 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP5P51878 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP5P51878 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP5P51878 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP5P51878 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP5P51878 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms