Protein–RNA interactions for Protein: P51798

CLCN7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN7P51798 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCN7P51798 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCN7P51798 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms