Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms