Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CA4P22748 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CA4P22748 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CA4P22748 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CA4P22748 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CA4P22748 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CA4P22748 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CA4P22748 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CA4P22748 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CA4P22748 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CA4P22748 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CA4P22748 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA4P22748 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms