Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGA1P17096 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGA1P17096 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms