Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP3P12645 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BMP3P12645 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP3P12645 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BMP3P12645 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP3P12645 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BMP3P12645 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BMP3P12645 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP3P12645 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms