Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM49CP0CI26 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49CP0CI26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49CP0CI26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms