Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD6O43541 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms