Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCP110O43303 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCP110O43303 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCP110O43303 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCP110O43303 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCP110O43303 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCP110O43303 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCP110O43303 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCP110O43303 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms