Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4BP3O15049 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms