Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAD1O00515 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAD1O00515 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAD1O00515 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAD1O00515 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAD1O00515 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAD1O00515 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAD1O00515 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAD1O00515 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAD1O00515 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms