Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3KRW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3KRW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3KRW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3KRW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
J3KRW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
J3KRW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3KRW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms