Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM3A6NDB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms