Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT87PA6NCN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms