Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFAP69A5D8W1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP69A5D8W1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms