Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG6Q9Y2V7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms