Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms