Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNIKQ9UKE5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNIKQ9UKE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms