Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CGGBP1Q9UFW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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