Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA2Q9UBT2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA2Q9UBT2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms