Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPG2Q9UBF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms