Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC4BQ9NT99 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC4BQ9NT99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms