Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRA6Q9BX79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms