Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP85Q9BW27 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms