Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED9Q9BVK6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED9Q9BVK6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms