Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPEPQ99797 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms