Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN2Q99700 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN2Q99700 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN2Q99700 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN2Q99700 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN2Q99700 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN2Q99700 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms