Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM4SF19Q96DZ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TM4SF19Q96DZ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms