Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARRDC3Q96B67 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC3Q96B67 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC3Q96B67 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms