Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKL2Q92772 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms