Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOPBP1Q92547 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms