Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms