Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C4orf3Q8WVX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf3Q8WVX3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms