Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms