Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC181Q5TID7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC181Q5TID7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC181Q5TID7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms