Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WASHC2DQ5SRD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms